Przy bazylice mniejszej w Świętej Lipce funkcjonuje również muzeum, które obsługują jezuici. Świętolipskie Muzeum Jezuitów zostało otwarte 19. 05. 1969 r. Obecnie muzeum znajduje się w budynku obsługi ruchu turystycznego zlokalizowanym przy sanktuarium maryjnym. Ekspozycje zajmują dwie sale na parterze oraz całe poddasze.
Ekspozycje stałe Muzeum:
Oprócz tego muzeum jezuitów przygotowuje również rozmaite wystawy czasowe.